雖然歐盟排放體系取得了很大成效，但其仍然存在一些缺陷和不足。

   （一）配額過剩

歐盟碳排放交易體系建立之初，是由各成員國自行設(shè)定排放量配額上限。過高的上限使得EU ETS在2007年底第一階段結(jié)束之際，實際二氧化碳排放量比設(shè)定配額還要低7%。2008年經(jīng)濟(jì)危機(jī)以來，歐盟制造業(yè)一蹶不振，二氧化碳排放量急劇下降，碳排放配額過剩更加嚴(yán)重。直到2014年，整個EU ETS中仍有約13億碳排放許可過剩。 

　　過剩的供應(yīng)壓低了污染者的排放成本，導(dǎo)致配額價格持續(xù)下跌。EU ETS設(shè)計初期，每噸碳排放許可交易價格在25到30歐元之間，在2007年中期曾達(dá)到過35歐元。隨后由于配額過剩，碳排放交易價格直線下滑，最低時一度觸及2.5歐元，直至2014年，碳排放交易價格基本在4.3歐元到5歐元之間。極低的配額價格使生產(chǎn)者以微小代價即可獲得大量排放許可，反而不利于減排技術(shù)的進(jìn)步。