而對于企業(yè)碳排放權(quán)的內(nèi)控管理應(yīng)涉及期初、期中、期末三個時間節(jié)點(diǎn)進(jìn)行宏觀規(guī)劃。每年年期初或上年年末，管理層應(yīng)根據(jù)本年預(yù)算收入計劃，計算本年產(chǎn)量，從而估算本年二氧化碳預(yù)計排放量并與當(dāng)年可獲得的碳配額進(jìn)行對比。根據(jù)差額的多少，使用科學(xué)的決策方法，對從開展內(nèi)部減排項(xiàng)目、合理分配配額、購買或出售配額以及購買ccer等所有可選項(xiàng)進(jìn)行財務(wù)評估，從中選擇成本最低資金效率最高使用企業(yè)資源最少的決策方案，實(shí)施最優(yōu)戰(zhàn)略。

在制定完當(dāng)年的碳排放權(quán)戰(zhàn)略后，如果在執(zhí)行階段沒有有效的風(fēng)險監(jiān)控和預(yù)警制度，則計劃只能流于形式而無法對企業(yè)產(chǎn)生任何實(shí)質(zhì)性貢獻(xiàn)。所以每月或每季度須將實(shí)際碳排放使用情況與預(yù)算進(jìn)行對比，才能及時發(fā)現(xiàn)異常項(xiàng)，分析差異原因以及調(diào)整以后階段的碳排放策略從而保證全年的碳排放權(quán)任務(wù)順利完成。

而到期末則應(yīng)對全年實(shí)際排放量與預(yù)估排放量進(jìn)行對比，分析本年項(xiàng)目執(zhí)行中的不足以及期初預(yù)算時為考慮到的特殊事項(xiàng)，并尋找解決方法，以此完善下一個周期的碳排放計劃。