根據(jù)《京都議定書(shū)》中8%的減排承諾目標(biāo)，歐盟15個(gè)成員國(guó)在1998年6月達(dá)成了一項(xiàng)《負(fù)擔(dān)分?jǐn)倕f(xié)議》（Burden Sharing Agreement，BSA），同月，歐盟委員會(huì)發(fā)布題為《氣候變化：后京都時(shí)代的歐盟戰(zhàn)略》的報(bào)告，提出應(yīng)該在2005年前建立歐盟內(nèi)部排放交易體系。2003年10月25日，2003／87／EC排放交易指令正式生效，宣布EUETS從2005年1月1日開(kāi)始正式運(yùn)行，世界上最大的跨國(guó)家、跨行業(yè)溫室氣體排放交易體系由此建立，目前規(guī)定了三個(gè)實(shí)施階段。

　　第一階段從2005年到2007年，是試驗(yàn)性階段，主要目的是“在行動(dòng)中學(xué)習(xí)”（Learning by Doing），為關(guān)鍵的下一階段積累經(jīng)驗(yàn)，進(jìn)行必要準(zhǔn)備。該階段限排的行業(yè)主要是能源生產(chǎn)行業(yè)和能源密集型行業(yè)，涉及五個(gè)部門(mén)，即能源供應(yīng)（包括電力、供暖和蒸汽生產(chǎn)）、石油提煉、鋼鐵、建筑材料（水泥、石灰、玻璃等）、紙漿和造紙。該階段排放量的上限被設(shè)定在6 600萬(wàn)噸C02，不包括非二氧化碳的溫室氣體。在成員國(guó)國(guó)內(nèi)法層面，國(guó)家分配方案（NAP）是歐盟排放交易體系運(yùn)行的基本前提。歐盟雖然設(shè)計(jì)了排放交易體系的結(jié)構(gòu)，但各成員國(guó)的排放總量和分配給國(guó)內(nèi)各管制對(duì)象的EUA的數(shù)量，是由各成員國(guó)自己決定的。每個(gè)成員國(guó)要提交一份國(guó)家分配方案（NAP）給歐盟委員會(huì)，并在其中詳細(xì)說(shuō)明相關(guān)信息。歐盟委員會(huì)對(duì)所有NAP進(jìn)行評(píng)估，以決定其是否符合EUETS法令規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn)。該階段，管制對(duì)象每超標(biāo)排放1噸二氧化碳被處以40歐元的罰款。

　　第二個(gè)階段是從2008年到2012年，該階段是實(shí)現(xiàn)歐盟各成員國(guó)在《京都議定書(shū)》中的全面減排承諾的關(guān)鍵時(shí)期，減排目標(biāo)是在2005年的排放水平上各國(guó)平均減排6.5%。從這一階段開(kāi)始，EUETS的覆蓋范圍除了歐盟的27個(gè)成員國(guó)外，還包括了歐洲經(jīng)濟(jì)區(qū)的冰島、挪威和列支敦士登三國(guó)。這一階段首次考慮將航空業(yè)納入減排管制體系。該階段強(qiáng)調(diào)并加入了儲(chǔ)備（Banking）概念，以便為EUETS帶來(lái)市場(chǎng)活力和連續(xù)性，旨在鼓勵(lì)排放者根據(jù)他們現(xiàn)實(shí)狀況和對(duì)未來(lái)碳價(jià)格的預(yù)期進(jìn)行額外減排。該階段，對(duì)超標(biāo)排放的懲罰從第一階段的40歐元／噸上升到100歐元／噸，在次年的企業(yè)排放許可配額中還要將超標(biāo)的數(shù)量予以扣除。