歐盟碳排放交易體系試驗階段的主要目的是發(fā)現(xiàn)并彌補設計缺陷、積累總量交易機制經(jīng)驗。針對排放交易體系試驗階段中所暴露出的問題，歐盟對其進行了改進，使其更加完善。這些缺陷及其改進措施主要在三個方面。 

　　一是排放權發(fā)放超過實際排放量問題。例如，在2005 年，所發(fā)放的排放權超過實際排放量4%，沒有一個產(chǎn)業(yè)的排放權處于短缺狀態(tài)，鋼鐵、造紙、陶瓷和廚具部門的排放權發(fā)放量甚至超過實際排放量的20%。排放權總量過多，導致排放權價格下降，環(huán)境約束軟化，企業(yè)失去了減排的積極性。針對這個問題，歐盟在排放體系實施的第二階段，下調(diào)了年排放權總量。調(diào)整后的年排放權平均比2005年低6%。 

　　二是排放權免費分配問題。第一階段排放權是免費發(fā)放給企業(yè)的，并且電力行業(yè)發(fā)放過多，結果電力行業(yè)并沒有用排放權抵免實際排放量，而是把排放權放到市場上出售，獲取暴利。在第二階段，政府提高了許可權拍賣的比例，并降低了電力部門的發(fā)放上限，迫使電力企業(yè)采取措施降低碳排放。 

　　三是微觀數(shù)據(jù)的缺失問題。歐盟排放交易體系試運行時，企業(yè)層次上的二氧化碳的排放數(shù)據(jù)是不存在的，排放權只能根據(jù)估計發(fā)放給企業(yè)，由此產(chǎn)生排放權發(fā)放過多、市場價格大幅波動等諸多問題。但歐盟利用三年試驗期，不斷地收集、修正企業(yè)層次上的碳排放數(shù)據(jù)，現(xiàn)已建立起龐大的支持歐盟決策的關于企業(yè)碳排放的數(shù)據(jù)庫。